破劫之碑的光芒驱散轮回迷雾后，宇宙迎来了短暂的安宁。但这份平静如镜中花般脆弱——无界医盟的终极监测仪突然捕捉到宇宙微波背景辐射中出现异常波动，所有星系的恒星开始以超乎常理的速度消耗能量，熵增进程被强行加速千倍。更令人绝望的是，一种名为“熵寂孢子”的神秘物质在虚空中扩散，所到之处，物质迅速崩解为最原始的粒子，连时间与空间的结构都开始扭曲变形。
秦溯在医道传承院感受到异动时，老槐树的树干轰然炸裂，从中飞出初代神农最后的意识残片。神农的虚影手持一株即将枯萎的“生命之树”，叶片上的纹路与宇宙星图完全重合：“当熵寂降临，万物将归混沌。但混沌亦是新生的温床，唯有以所有生命的信念为种，方能在终焉中孕育希望。”与此同时，秦曦的量子实验室被熵寂孢子侵蚀，所有精密仪器在瞬间锈迹斑斑，化作尘埃。
循着危机的源头，探索小队抵达宇宙边缘的“熵寂深渊”。这里不再是人们认知中的空间，而是一片沸腾的混沌海洋，无数文明的残骸在熵能漩涡中沉浮。深渊中央，一座由破碎的黑洞与超新星残骸堆砌而成的“熵寂王座”缓缓升起，王座之上，一个由纯粹熵能凝聚而成的身影若隐若现——自称为“熵寂之主”的存在。他的声音如同宇宙终焉的丧钟：“秦溯，你们执着于延续文明的火种，却不知熵寂才是万物的宿命。一切都该回归虚无，从无到无，才是永恒的真理。”
熵寂之主挥动手臂，熵寂孢子如黑色暴雨般倾泻而下。接触到孢子的星球，山川河流瞬间崩解，生命体在熵增的剧痛中化为齑粉。自由残缺派与火种重启派的联合舰队在熵能风暴中支离破碎，他们的高科技武器还未发射便分解成基本粒子，魔法护盾在熵寂之力面前如同脆弱的肥皂泡。秦溯发现，常规手段对熵寂之主完全无效，因为对方本身就是熵增定律的具现化存在。
生死存亡之际，秦溯发起“星火永恒计划”。他向全宇宙发出最后的号召，征集每个文明最珍贵的记忆、最坚定的信念与最炽热的希望：原始人类第一次摩擦生火的专注、科学家在实验室中千万次失败后的坚持、恋人跨越星河的深情凝望。这些承载着生命意志的力量，通过量子网络汇聚成璀璨的“永恒火种”，注入秦溯的青铜罗盘。秦曦带领团队，利用历代危机中留存的能量，制造出“熵能中和矩阵”，试图对抗疯狂的熵增。
最终决战在熵寂深渊展开。秦溯高举燃烧着永恒火种的罗盘，与熵寂之主展开一场关乎宇宙命运的终极较量。在火种的光芒中，熵寂之主的熵能身躯开始出现裂痕，他看到了无数震撼的画面：在超新星爆发的废墟上，新的行星正在孕育；在冰封的世界里，生命以顽强的姿态破土而出；在末日的黑暗中，文明的火种在传承者手中永不熄灭。“原来...熵寂不是终点，而是新生的序曲...”熵寂之主的声音中第一次出现了动摇。
随着熵寂之主的消散，熵寂孢子开始逆向转化为滋养万物的“创生能量”。熵寂深渊化作一片充满生机的“新生星云”，每一颗闪烁的星辰都代表着一个浴火重生的文明。危机过后，秦溯在青山村建立“永恒之塔”，塔顶的火焰永不熄灭，象征着生命的意志与希望。新石碑上刻着：“熵寂非终焉，新生自永恒。医道的真谛，是守护每一个生命在毁灭与重生的循环中，永远追寻光明的勇气。”
星河之中，秦逸与林婉的星光融入永恒之塔的光芒，与全宇宙的生命之光交相辉映。从此以后，医道的传承者们带着这份信念继续前行，他们明白，只要生命的意志尚存，无论面对怎样的危机，宇宙都将在毁灭与新生的永恒循环中，绽放出更加绚烂的光彩。