范伟得到了父亲的消息，就让看守吴方琪的人，把两人单独关到了一间密室，锦衣卫告发了吴方琪，皇上下令秋后问斩，这问斩人就交给了东厂看押，而这个密室是东厂专属的。刚开始东厂把吴方琪关在了密室，也是临时性过度一下，也不供饭菜。就出现了吴方琪两人在牢里的那一幕，汤不是汤，水不像水的那种伙食。
从范文杰在河北冀县的弟子得到这个信息，到范伟派人到太湖告诉父亲这个事情，再用信鸽传书让范伟把那个考生保护起来，这一来一去，一个月的时间就过去了。东厂的人得到范伟托来的口信，就把那个考生的情况一五一十告诉了范伟，然后，吴方琪两人的伙食也得到了改善，汤里也多加了点米粒和素菜。范伟得到了这个考生的详细情况，就用信鸽传书方式告诉了父亲。
不曾想，范文杰收到信的时候，张立山正好处在病危中，未能暇接，放到了一旁，等张立山的病被程宝珠带来的孙子治好了之后，回到自己的房间里，才开打书信，一看果然就是那个神童，神童叫吴方琪。这个神童与吴方璞就一字之差，就把张平叫进房间里，问那个神童和吴方璞像不像。经范文杰这么一说，还真是，张平当即就肯定就是神医的弟弟，也就是程宝珠另一个孙子。虽近九十的老人，一时控制不住了自己，拉开房门正想去告诉师妹。忽然一想，她的孙子现在仍处在危险之中，随时都会被皇帝问斩，就退了回来。
张平少年老成，见范师伯这种复杂的心情，就让师伯先不要告诉她们母子两人，等事情处理完了之后再告诉她。年纪老了，又刚刚从死神里走了一趟，经不起激动，自己父亲刚好，不能再有事端了。范文杰也别无选择，就开始调动起自己在东厂的关系网。
皇帝贴身的太监，大内总管，是河北冀县人，家里人长期以来都与范文杰有来往，而且交情很深，其中家族中就有一人是自己的徒弟。这密信是锦衣卫递交上去的，让锦衣卫的人出面保从常理上说不通，而让东厂出面阻止是个最好的选择。于是就亲自写了一封书信，让儿子交给东厂里的领头，让大内总管接应，东厂，西厂双管齐下，想必事情能办成。
张立山身体正处在复元之中，范文杰没有告诉他，所有的一切行动也只能由自己一个人来规划了。几乎是每天都有范伟来的信鸽传书，东厂，西厂都如他所愿调动了起来，东厂将吴方琪的真实情况一一列到了信上，又通过西厂的大内太监传递给了皇上。
宣德皇帝在这件事上很有主见，东厂与锦衣卫的设置在洪武皇帝朱元璋的时候就有了，然而这种的设置本身就是一种相互牵制，东厂与锦衣卫相互之间攻汗的事情没少发生，一切的判断都要靠皇帝自己，如果偏信于一方，就将会给朝廷带来麻烦。
当时自己下令秋后问斩，关键的也就是一个问字，未问先斩那是欺君，而这一问时间就向后推了，皇帝那么做一是维护自己的威信，又给锦衣卫留足了面子。皇帝知道，一个小小的书生，才十几岁不可能会与太湖水寨有什么关联，这锦衣卫拿一个十几岁的人做文章，有点小题大做了。但毕竟涉及到太湖水寨，多年来不约管制，严重影响了国库收入，不得不惩鉴一下，以示圣明。
这考生的背后肯定不会这么简单，事出有因，不会这么无缘无故。出于多方面的考虑，考生交给东厂，并下密旨不得伤害性命。西厂总太监，大内总管向皇上进言，人才难得，让内卫将这个考生带到宫内，由皇帝自己进行审理。皇帝采纳了这个建议，让主考官带考生进宫。
第二天寅时刚到，主考官从东厂将吴方琪提了出来，从东华门送进宫。麻布套住头部，手带铁了铐，到了皇帝前跪下，内卫将麻布去掉。吴方琪知道对自己开始提审了，随着提审官，弯来弯去不知要提到那里去审，带到了一个地方，走了很长一段石台阶，走进房间跪到了地上，内卫把蒙头的麻布摘去，低着头，跪卧在地上。
只听见主考官与皇帝细声说了几句后，主考官开始发话了“你是那里人，今年几岁，在北京有没有同伙。”
吴方琪那敢多言其他“信安县城里人，今年十六岁，在北京只有一个同伙。”
主考官发问“北京的同伙现在那里。”
吴方琪说“在关押的地方。”
“你们两人谁是主谋。”
“他是我的书童，没有主谋。”这下子主考官问不下去了。
皇帝亲自宫殿审问考生，既怕这考生的家人真有与太湖水寨人什么关联，又怕失去了一位治国安邦的人才，主考官和大内太监站在下面对考生一一盘问，见主考官没有接上，大内总管太监走到考生旁边，怪声怪气的话“你的父母做什么的？”
“我的父母没有什么，父亲给县衙门县老爷帮衬做事，母亲在家。”
“你的兄弟姐妹有没有做水上生意的。”
“没有，都是信安城里平常的老百姓。”
“那你的祖父祖母又是做什么的。”这下子吴方琪没有立即回答太监的问话，在回忆。
“怎么啦，你祖父祖母是做什么的，是走江湖的吧。”
“祖母是河北冀县人，遇到了我爷爷就离开了河北冀县到信安县去了，她老人家在两年前逝世的。”
大内总管，太监停着了提问，宣德皇帝向这个大内总管看过了一眼，又向主考官示意提问。主考官对吴方琪提问“刚刚问你，你祖父祖母是不是走江湖的，怎么回答不上来了。”
“我从来都没有见过祖父，在我父亲十二岁的时候，我的祖父就没有了音信，到现在还不知道身首在那里。”吴存义那个时候还才十二岁，对父亲的情况只能听母亲说。