黑暗之门的能量节点被摧毁后，宇宙同盟获得了短暂的喘息机会。林风返回中枢塔，与苏沐雪等人汇合，讨论接下来的应对之策。苏沐雪将最新研发的科技武器投影在大屏上，这是结合了修真本源能量和机械技术的“万灵战舰”，舰身由岩魔族提供的特殊矿石炼制，能够吸收周围的本源能量，舰首的主炮可以发射融合混沌、灵曦、雷泽三种能量的超级光束。
目前已经量产了一百艘万灵战舰，分布在各个星域的防线。苏沐雪说道，这种战舰的威力远超之前的机械战舰，能够有效克制黑暗能量，而且船员可以通过体内的本源能量与战舰形成共鸣，发挥出更强的战力。
林风点头，立刻下令将万灵战舰部署到黑暗之门前线。与此同时，西部星域的岩魔族传来消息，他们发现了一处上古矿脉，矿脉中蕴含着大量的“本源矿石”，能够进一步提升万灵战舰的性能。萧辰主动请缨，率领工程舰队前往矿脉开采，同时护送矿石返回总部。
萧辰的舰队抵达西部星域时，发现矿脉周围已经出现了少量黑影战士的踪迹。这些黑影战士似乎是专门来阻止矿石开采的，数量虽然不多，但实力都达到了大乘期初期。萧辰没有丝毫犹豫，下令万灵战舰展开攻击。
舰首的主炮亮起三色光芒，超级光束如同利剑般射向黑影战士。黑影战士试图用黑暗能量抵挡，却被光束瞬间穿透，身体化为灰烬。剩余的黑影战士见状，纷纷四散奔逃，萧辰下令舰队追击，将其彻底清理。
开采工作顺利进行，岩魔族的矿工们驾驶着采矿机器人，深入矿脉挖掘本源矿石。矿石刚被开采出来，就散发着浓郁的本源能量，与万灵战舰的能量系统产生共鸣。萧辰将第一批矿石送往总部，苏沐雪的科研团队立刻开始升级万灵战舰。
升级后的万灵战舰，主炮威力提升了三成，防御能力也大幅增强，还新增了“本源护盾”，能够自动吸收黑暗能量转化为自身动力。林风亲自试驾了升级后的战舰，感受到其强大的性能，心中更加有底。
就在此时，黑暗裂缝深处传来异动，噬界之主的气息变得越来越强烈，黑暗之门的周围再次聚集了大量的黑影战士，而且出现了许多体型庞大的黑暗巨兽。这些巨兽高达数十丈，周身覆盖着厚厚的黑色鳞片，能够喷吐黑暗火球，威力无穷。
林风下令万灵战舰编队出击，一百艘战舰组成楔形阵，朝着黑暗巨兽冲去。战舰的主炮同时发射，三色光束交织成网，将数只黑暗巨兽笼罩。黑暗巨兽的鳞片虽然坚硬，但在超级光束的攻击下，还是出现了裂痕，发出痛苦的嘶吼。
阿炎率领净化部队配合战舰攻击，灵火能量与光束结合，形成火焰风暴，灼烧着黑暗巨兽的伤口。水域族的修士释放出大量水流，将黑暗火球扑灭，同时净化被污染的区域。凌云的空间小队则潜入黑暗巨兽群中，用空间之刃攻击它们的眼睛等薄弱部位。
激战持续了整整一天，万灵战舰展现出了强大的战力，共斩杀了三十多只黑暗巨兽，残余的黑影战士和巨兽再次退回黑暗之门内。这场战斗让宇宙同盟的士气大振，也证明了科技与修真结合的可行性，为后续的战斗积累了宝贵的经验。
林风知道，这只是噬界之主的试探性攻击，真正的大战还在后面。他下令加快本源矿石的开采速度，继续升级万灵战舰，同时让各种族加强修炼，提升自身实力。宇宙同盟的备战工作，进入了更加紧张的阶段