格物院以一系列务实成果初步证明了自身价值，朝堂之上针对其“无用”的攻讦暂时平息。然而，利益的触动与理念的冲突，从未真正消失。它们如同暗流，在平静的海面下悄然汇聚，只待一个合适的时机，便会掀起新的波澜。而这波澜的起点，竟源于一次看似寻常的“天灾”。
初夏，京师地区连续出现异常天气，先是连日阴雨，继而小范围冰雹损毁了些许农田。这本是寻常气象，却被钦天监中一位与保守派关系密切的官员抓住了机会。
他连夜密奏皇帝，称观测天象，发现“荧惑守心”、“异星犯紫微”，乃大凶之兆，主“刀兵”、“饥馑”，并隐晦地将此天象与“不尊古制、妄兴奇技”联系起来，暗示这是上天对朝廷偏离“正道”的警示。
这份密奏，如同一点火星，瞬间点燃了保守派心中积压的不满。他们虽不敢明指林凡，却在各种场合散布“天象示警，当反省政事”的言论，试图借此营造不利于新政的舆论氛围。
江南的残余势力敏锐地捕捉到了这个机会。他们迅速行动，一方面资助那些反对新政的文人，在江南各大书院鼓噪“新政扰天，故降灾异”；另一方面，故技重施，再次伪造了一份来自江南数州、声称受新政“苛政”所苦、祈求朝廷“回归仁政”的“万民折”，并通过其在朝中的代理人，迅速呈递御前。
这一次，他们学乖了，不再直接攻击林凡，而是将矛头指向具体的新政措施，如指责“清丈田亩”实为“与民争利”，“推广新农具”是“强迫百姓”，将天灾与人祸巧妙地嫁接在一起。
朝会之上，几位御史再次出列，言辞不再像上次那般激烈，却更加阴险。
“陛下，天象示警，不可不察。近来京畿灾异，江南民情浮动，是否当暂缓某些过于激进之举，以示敬天爱民之心？”
“格物院虽有小成，然其专注奇巧，是否过于侧重‘器’而忽略了‘道’，以至引得天道不满？”
这些言论，裹挟着“天意”与“民意”，极具迷惑性。就连一些原本中立的官员，也开始面露犹疑。皇帝看着御案上那份厚厚的“万民折”，听着殿下“顺应天意”的呼声，眉头紧锁，目光再次投向了林凡。他可以无视朝争，却无法完全忽视“天意”与“民怨”的压力。
面对这新一轮裹挟着“天命”与“伪民意”的攻击，林凡知道，简单的辩解或强硬的反驳都已无效。他必须用更高级的方式破局。
他并未立刻在朝堂上争辩，而是做了一件让所有人意想不到的事。他请求皇帝，允许格物院与钦天监，就此次“异常天象”进行一场公开的联合观测与研讨。
“陛下，天象高远，非人臣可妄测。然格物之道，在于观测、记录、推演。臣请陛下允准，令格物院地理科、算学科，协同钦天监，共同记录近日天象、气温、风向、雨量等数据，并查阅历史档案，比对类似气象记录，以科学之法，探究此次天气异常之成因。如此，方能明辨是非，不致为虚言所惑。”
这一招，以其人之道还治其人之身。你们不是谈天象吗？那我就用你们不敢想象的、系统性的观测和数据来分析天象！将虚无缥缈的“天意”，拉回到可以观测、可以讨论的现实层面。
得到皇帝默许后，格物院立刻行动起来。地理科的学员们，在林凡的指导下，制作了简易的雨量器、风向标，设立了数个观测点，日夜记录数据。算科学员则负责整理数据，并查阅翰林院和钦天监存档的历代气象记录。
数日后，一份由格物院和钦天监部分开明官员联合署名的《京畿异常天气观测分析》呈递御前。报告以详实的数据指出，此次连阴雨及冰雹，与历史上某年同期气象记录高度相似，乃特定气候条件下的正常现象，并初步分析了其形成机制（冷暖气流交汇），与所谓的“荧惑守心”等星象并无直接关联。报告还附上了详细的观测记录和数据对比图表，逻辑清晰，证据确凿。
与此同时，林凡动用“驿路”力量，迅速查清了那份“万民折”的造假源头，并将部分证据巧妙地透露给了几位以刚直着称的御史。
面对格物院那份条理分明、数据详实的报告，以及暗中传来的关于“万民折”造假的信息，皇帝心中的疑虑顿时烟消云散。他震怒于有人竟敢屡次伪造民意、利用天象欺君罔上！
在接下来的朝会上，皇帝严厉申饬了那些借天象攻讦政事的官员，并明确表态：“天行有常，不为尧存，不为桀亡！日后凡天象之事，当以钦天监与格物院会商为准，不得再妄加附会，淆乱视听！至于江南……朕自会派人核查真情实况，若再有无端构陷者，定严惩不贷！”
皇帝的支持，如同定海神针，瞬间稳住了局面。那些兴风作浪者，见势不妙，立刻偃旗息鼓，再次缩了回去。
这场风波，让安儿（林怀瑾）和格物院的学员们深受触动。
“父亲，以往只觉天意高难问，如今方知，天地运行，亦有规律可循。”安儿感叹道，“以数据破虚妄，以观测证真实，这才是格物精神所在。”
林凡欣慰地看着儿子：“不错。这世间许多看似神秘莫测之事，不过是尚未被认知的规律。格物之目的，便是拨开迷雾，探寻真相。这不仅需要知识，更需要不盲从、不迷信的勇气和求真务实的态度。”
经此一役，格物院内部的气氛更加凝聚，一种基于实证和理性的“格物精神”开始在这些年轻学子心中深深扎根。
就在京华风波刚刚平息之际，宸亲王八百里加急军报传入京城：东南沿海发现大规模、装备精良的西方舰队踪迹！其船坚炮利，数量远超“黑潮”海盗，目的不明，已在南洋与我方商船发生小规模摩擦，形势骤然紧张！
这则消息，像一道真正的惊雷，劈开了朝堂上关于“天意”、“古道”的无谓争论。所有人才赫然发现，外部的威胁，远比内部的纷争更加真实和紧迫。
风起于青萍之末，止于草莽之间。一场借天象发起的攻讦，最终被科学的数据与皇帝的明断所化解。然而，西方舰队的阴影，已然笼罩在海疆之上。林凡知道，接下来的挑战，将不再是内部的理念之争，而是关乎国运的、实实在在的生存竞争。格物院和他所推行的一切，即将迎来最严峻的考验。