概念侵蚀的危机暂告段落，宇宙却迎来更致命的威胁。裂缝文明的能量监测网发现，在宇宙诞生的“原初奇点”旧址，暗紫色的熵寂能量正在疯狂汇聚，形成一个不断膨胀的“本源黑洞”。这个黑洞不仅吞噬物质与能量，更将触及到宇宙本源规则的核心。不完美之种的藤蔓在接近黑洞时，瞬间被分解成最原始的粒子，林婉的星光在花蕊中剧烈闪烁后彻底熄灭：“这是熵寂对宇宙本源的终极反噬...所有规则都将被改写！”
秦逸的平衡印记剧烈灼烧，几乎要从他体内挣脱而出。他的意识被强行拽入一片虚无的领域，这里只有暗紫色的混沌在翻涌。黑袍人的意识已与混沌融为一体，声音带着宇宙终结的威压：“秦逸，这场游戏该结束了。本源黑洞将吞噬所有的秩序与生机，让宇宙回归最纯粹的熵寂。”随着话音，领域内投影出末日景象：恒星在黑洞的引力下扭曲成漩涡，行星被撕成原子，所有文明的痕迹都在消散。
觉醒者们驾驶经过本源能量改造的“归墟号”战舰，向着原初奇点进发。刚靠近本源黑洞，战舰便遭遇“熵寂本源使”的阻拦。这些使者由纯粹的熵寂本源之力凝聚而成，拥有扭曲宇宙规则的能力：有的抬手就能改变引力常数，让物质分崩离析；有的低语便能逆转热力学定律，让能量从有序变为无序。残缺派修士燃烧最后的本源，发动禁术“万劫混沌诀”，但混沌能量在接触使者的瞬间，反而被转化为强化对方的力量；裂缝文明将战舰所有能源注入“规则重构炮”，炮弹却在发射后被使者篡改轨迹，轰向己方阵营。
“它们的力量来自对本源规则的操控！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的信念连接，启动“本源共鸣系统”。全宇宙生命对生存的渴望、对秩序的坚守，化作金色的能量洪流。在洪流冲击下，部分熵寂本源使的形态出现不稳定，显露出内部本源能量的运转轨迹。秦逸抓住机会，挥动融合武器，斩出“逆命本源斩”，剑刃上的共生纹路与平衡印记迸发耀眼光芒，暂时击退了敌人。
突破防线后，归墟号抵达本源黑洞核心。黑洞表面流转着暗紫色的本源纹路，每一道纹路都对应着一条宇宙规则。黑袍人的意识体悬浮在黑洞上方，狞笑着注入能量：“当黑洞吞噬所有规则，新的宇宙将在熵寂中重生——没有文明，没有生机，只有永恒的虚无！”
本源黑洞突然释放“熵寂终焉之息”，暗紫色的能量风暴所到之处，空间被折叠成虚无，时间停止流动，所有规则都在崩塌。归墟号的防护罩在风暴中瞬间破碎，船员们的身体开始分解成基本粒子，意识也逐渐被熵寂同化。千钧一发之际，秦逸将秩序之匙、终焉之剑、不完美之种以及全宇宙文明的共生信念彻底融合，在虚空中凝聚出“永恒共生本源核”。
核体散发出的光芒与终焉之息激烈碰撞，在能量的交锋中，秦逸的意识与原初熵寂的本源意志展开终极对决。“文明不是宇宙的负担，而是奇迹的创造者！”秦逸将共生理念化作最纯粹的力量，“真正的宇宙，应该是秩序与生机的永恒共舞！”当“逆命永恒新生”的光芒刺入本源黑洞，整个宇宙剧烈震颤。
黑洞开始崩解，黑袍人的意识发出不甘的怒吼，消散在能量风暴中。但在黑洞彻底毁灭前，一道暗紫色的光芒射向宇宙深处，预示着熵寂与共生的博弈永远不会真正结束。秦逸望着逐渐恢复平静的宇宙，知道新的挑战还在前方。不完美之种重新长出嫩芽，藤蔓缠绕在归墟号上，象征着希望与新生。而觉醒者们，将永远守护这份来之不易的平衡，迎接未知的未来。