叶修带领获救的菌裔突破暗物质裂隙时，宇宙的战火已呈燎原之势。机械文明的量子巨炮正在轰击菌裔母星的防护罩，魔法议会的元素洪流将星域染成诡异的紫色，而新医道联盟的总部混元中枢，正被自由残缺派的黑客军团入侵，防御系统警报声此起彼伏。
“必须立刻阻止这场自相残杀！”叶修操控穿梭舰冲向战场最核心，手中太素残页突然迸发强光，在空中投射出林婉与秦逸融合星孩石卵时的全息影像。那道金色光芒穿透硝烟，让激战中的各方势力短暂停滞——机械战士的枪管垂下，魔法师的咒语消散在风中，菌裔们挥舞的菌丝利刃也停止颤动。
然而，火种派新领袖的机械义眼红光暴涨：“不过是虚假的幻象！攻击！”随着他的指令，新一轮攻势更加猛烈。叶修咬牙切齿，突然将太素残页按在穿梭舰能源核心上：“启动共生过载模式！”整艘舰船瞬间被金紫交织的光芒包裹，如同一颗燃烧的流星，径直撞向即将发射毁灭光束的机械旗舰。
在撞击的前一刻，叶修被菌裔们用共生茧强行弹出。巨大的爆炸中，机械旗舰的主炮阵列被摧毁，冲击波震碎了魔法议会的浮空堡垒。叶修从菌丝茧中爬出，浑身是血却眼神坚定，他举起从旗舰残骸中找到的量子密钥，对着战场高喊：“看看你们在做什么！终末核心的残片正在暗处嘲笑我们！”
混乱中，一位来自原始部落的长老突然站了出来。他的生命古树虽被菌丝侵蚀，却仍绽放着象征希望的新芽：“我感受到了古树的低语...这场战争，正是黑暗势力想要的结果。”他的话如同一把重锤，敲醒了部分陷入狂热的战士。机械文明的指挥官摘下头盔，露出疲惫的面容：“我们的数据库里，确实发现了异常的暗物质代码...”
叶修趁机召集各方代表，在一颗荒芜的卫星上展开紧急会议。这次，他不再依赖言语说服，而是将从暗物质裂隙带回的菌裔样本接入全息投影。众人惊恐地看到，被污染的菌裔细胞中，暗紫色的终末核心碎片正如同寄生虫般扭曲共生基因，而未被污染的菌裔血液，却能中和这种侵蚀。
“共生不是错误，被污染的信任才是！”叶修将自己的手臂划破，任由菌裔血液流入伤口。金色的神农血脉与紫色血液产生奇妙共鸣，伤口处的皮肤以肉眼可见的速度愈合，“我们需要的不是互相毁灭，而是重新建立信任！”他的举动让会场陷入死寂，许久，魔法议会的首席大巫师摘下象征权威的法冠：“或许...我们都被仇恨蒙蔽了双眼。”
就在联盟即将达成和解时，宇宙深处突然传来一阵超越维度的震颤。所有通讯设备同时亮起猩红警报，一个由黑色菌丝与暗物质交织而成的巨型网络，正以惊人的速度吞噬周边星系。自由残缺派的残存成员突然集体发狂，他们的身体膨胀成巨大的孢子囊，爆裂后释放出更多污染菌丝。
“终末核心的真正杀招来了！”叶修的太素残页剧烈发烫，残页上浮现出初代神农的最后箴言：“医道如环，破局需以苍生为引”。他猛然领悟，立刻启动混元中枢的广播系统：“所有文明听令！将你们最强大的治愈力量，通过共生网络汇聚！无论科技、魔法还是本能！”
机械文明贡献出储存着所有医疗数据的量子核心，魔法世界释放出封存千年的治愈圣典，原始部落的长老们以生命为祭唤醒大地之力，就连曾经敌对的火种派，也将归墟残能改造成能量增幅器。叶修站在能量洪流中央，引导着这股混杂着科技之光、魔法元素与生命本源的力量，注入太素残页。
残页化作一把巨大的钥匙，插入不断扩张的黑色网络核心。金色与紫色的光芒迸发，如同新生的宇宙大爆炸，将终末核心的污染力量层层剥离。但在光芒的最深处，叶修看到一双冷漠的眼睛——终末核心的真正本体，正在某个更高维度注视着这一切，等待下一次卷土重来的机会。