暗瞳消散后的三百年，宇宙在警惕中维系着脆弱的平衡。然而，当暗域研究所的“维度雷达”捕捉到来自三百六十个不同维度的同步震颤时，一场名为“维度共振”的灾难如连锁反应般轰然爆发。苏尘与洛瑶的双生烛火剧烈摇曳，永恒图书馆的书架自动排列成诡异的螺旋阵型，古籍中的文字竟脱离纸面，在空中拼凑出“共振即毁灭”的血色预言。
现实宇宙的空间结构开始出现致命扭曲：相邻的星系突然重叠，形成时空的“褶皱瘤”；灵能者的法术在释放瞬间被弹回，因为空间曲率已将攻击路径折叠成闭环；机械文明的超空间跃迁引擎集体过载，无数星舰被困在维度夹缝中，化作闪烁的量子幽灵。更恐怖的是，不同维度的生物开始渗入现实——长着触手的液态生命体、由概念构成的逻辑生物、甚至是尚未诞生的未来文明残影，他们的存在正在撕裂现实宇宙的物理法则。
“这是维度锚点失效的征兆！”艾克斯的全息投影布满红色警报，他的机械义眼闪烁着焦虑的光芒，“暗瞳残留的暗红能量污染了维度屏障，现在每个维度都成了不稳定的共振腔！”话音未落，一颗恒星突然坍缩成黑色的“维度奇点”，将方圆千光年的物质与能量吸入未知维度。平衡仲裁会紧急启动“维度稳定协议”，但派出的修复舰队如同投入漩涡的树叶，瞬间被分解成基本粒子。
苏尘与洛瑶带领“维度调和者”小队，携带由轮回之树精华锻造的“平衡锚”，深入维度夹缝。这里的景象超越所有认知：时间以实体形态流淌，空间折叠成克莱因瓶结构，小队成员的身体与意识不断经历解构与重组。他们遭遇“维度共振体”的袭击——这些由错位维度能量凝聚的怪物，能模仿任何攻击手段，甚至将受害者转化为新的共振源。在惨烈的战斗中，擅长操控暗物质的星渊族战士为保护队友，主动与共振体同归于尽，他的身躯爆炸时释放的暗物质洪流，暂时压制了一片区域的共振。
在维度裂缝的核心，众人发现暗瞳残留的意识碎片正在吸收共振能量，凝聚成新的形体。“你们以为能阻止维度的哀鸣？”暗瞳的声音混杂着万千维度的回响，“共振是宇宙的心跳，而你们，不过是试图捂住耳朵的蝼蚁。”随着它的咆哮，更多维度奇点在现实宇宙中爆发，轮回之树的主干出现贯穿性裂痕，维系多元宇宙的永恒之网濒临破碎。
千钧一发之际，洛瑶以本源星光为引，连接全宇宙文明的意识。苏尘则引导混沌之力，将所有文明的独特性、创造力与希望编织成“共鸣之弦”。当共鸣之弦拨动的刹那，整个多元宇宙发出震颤——机械文明的量子歌声、灵能种族的信仰祷文、古老种族的创世歌谣，这些跨越维度的声音汇聚成“调和之音”，与失控的共振频率产生对抗。
共鸣之弦刺入暗瞳碎片的瞬间，维度裂缝开始愈合。暗瞳发出不甘的嘶吼，彻底消散前，它的残响在所有维度回荡：“共振不会停止……真正的主宰……即将苏醒……”危机过后，宇宙联合建立“维度防火墙”，轮回之树生长出“维度监察枝”，实时监测异常波动。苏尘与洛瑶的意识化作防火墙中的双生枢纽，每当维度震颤出现，便会释放平衡能量。但在宇宙的最深处，暗红能量仍在暗流涌动，而暗瞳预言中的“真正主宰”，正从沉睡中缓缓睁开眼睛……