区晨及特战队在小山村停留了两天，实在是太累了，他让一些特战队员细细地抹除了日军来过的痕迹，这很重要。日军如果发现蛛丝马迹，这个村甚至周边村的人一个都不要想活。
区晨还安排特战队员们转运武器、弹药到隐蔽地点，做好记号。第三天他们虽然累但真的要走了，哨探已经发现有村民在村子周边探头探脑，特战队员不允许他们接近，示意他们离开。区晨向李振华报告了这事件，李振华让区晨带着特战队离开此地，武器弹荡他会安排人过来取，并让区晨及特战队员把这件事烂在肚子里，毕竟这涉及到了日军的密码。
区晨有些意外李振华这么痛快就让他们离开了此地，他甚至都有点怀疑李振华强留他们在此地，就是为了完成此事，转念想想又觉得不太可能。区晨这点就是好，不懂就把念头烂在心底。他的胸口挂着一台相机，这是刚缴获的，这样他就可以更方便的完成任务了。
区晨他们走了，小山村的村民陆续回到了村里，村里干净了很多。各家都多少丢了些的东西，但很快他们就发现丢了东西大多数在祠堂。他们对离开的那支部队很好奇，那支部队一溜烟就钻进了山里，不让他们接近。村子里隐隐有些血腥味，村民们发现村里明显经过打扫。他们又在村南发现熔洞口被封了，还堆了封土，上面还有个小庙，庙里有一尊地藏菩萨，这里的血腥味最重。村里长者让村民们把这事埋在心底，拿来香点燃、纸在烧上，供奉地藏菩萨保佑全村平安。随着供奉的人越来越多，血腥味闻不到了取而代之的是一股淡淡檀香的味道。
小菌江支队右路主力从山路直插太平汛，与由丽水北上迎击的保安第3团1个大队遭遇。稍一接触，该大队即退回丽水，日军分兵留守太平汛后进攻丽水，保安3团退出丽水，小菌江支队占领丽水。占领丽水都两天了，左路日军始终未到，小菌江邦雄怎么联系都联系不到，他派出一个大队到山中寻找，但始终未找到踪迹，山里也根本没有一丝战斗的痕迹，左路2000余日军就这样神秘的消失了。这一件事成为困扰日军的一个谜团。
小菌江邦雄实在找不到这群人，只好向第13军司令部报告，泽田茂臭骂了小菌江一顿。让他先放下此事、命令小菌江支队配合原田旅团一部先进攻温州，打下温州后再来寻找失踪部队。原田旅团来了两个大队，两部合力向温州进攻，攻占了温州、后又攻占瑞安。
国军开始对瑞安、温州、丽水进行骚扰，第88军从敌后经壶镇、缙云到云和赤石一带，与防守遂昌、松阳的暂9军汇合，对丽水、龙游产生很大的威胁。为消除威胁，日军以田原田支队为主力进攻遂昌、松阳。虽然暂9军、第88军派部队沿途阻击，但遂昌、松阳还是沦陷了。
浙赣铁路交通线在日军第13军的进攻下最终还是被打通了，日军在贵溪会师，日军战役目标达成。但西线第11军损失惨重，赣东战役第11军损失近余人，第3师团主力6000余人全军覆没，师团长阵亡，今井支队、原支队几乎全军覆没，只有零星不是千余人逃回金溪，损失8000余人，井手支队损失1800余人，第43师团损失3000余人。
此时日军又发现第49军阵地就在广丰以南不远的棋盘山，日军第15师团发起进攻，第49军抵抗一天后，退守信江西岸。第26军也北上推进至信江南岸，以第44师一部渡过信江进攻日军，一度击退三江桥、象鼻山的日军。但日军反击寸第26军又退回信江南岸，在广丰这一区域中日雨军也形成了对峙。
日军虽达到前期制定的作战目标，但派遣军司令畑俊六怎么也高兴不起来，此时日军部队已极度分散，浙赣铁路线频频遭到袭击，新四军也活跃了起来，在苏南、上海一带袭击日军据点。浙赣铁路线虽然打通了，但要固守，日军兵力又严重不足。浙赣线东段国军第三战区虽说损伤不小，但还远未到达伤筋骨的程度。浙赣线西段，国军第74军、第79军、第4军更是对日军第34师团构成严重的威胁。
中日两军处于胶着之中，日军没有能力消灭第三战区和第九战区四个军的力量，国军也有些打不动了，没有打算再去发动大的战役消灭日军，只是以游击战方式去消耗日军，避免国军精锐遭受损失。整个浙赣我处于这种诡异的平衡之中。
衢州机场已经修复完毕，上海方面的航空队也调了过来支援华中。日军在浙赣线周边一日路程之内进行系统性的抢劫、破坏。日本大本营指示金华的莹石矿（冶炼催化剂）是帝国所急需的资源，日军就开始掠夺劳动力，几万青壮被押到矿山劳作。日本大本营又指示铁路器材也是帝国所急需，日军就开始拆掉浙赣铁路铁轨，甚至是枕木也不留下，统统打包回国。
畑俊六最初的设想：打通浙赣铁路线，以增强华东与华中地区的兵力调度和物资运输能力，提升战略机动性。在此时已成为了泡影，大本营为了得到铁路器材，派来了关东军大量的铁路部队和铁路职工，太平洋战争爆发才大半年，日本的战争能力已接近到崩溃的边缘。日本本来本钱就小，还挑起了和美国的这场战争，怎么看都像是一个小商贩和超级富豪之间的斗富，到现在日本沦落到只能四处抢物资维特战争的地步，连铁轨、枕木都不放过了。
战役进行到现在这个地步，畑俊六也不得不开始考虑起撤退问题。问题回到了最初，日军退走了，中美修复机场怎么办？日本大本营已经为他想好了办法，关东军驻满洲第731防疫给水部队就可以完美解决这问题。
10月中旬731部队的创始人兼部队长石井四郎来了，随行的有731部队和南京1644部队150多人组成远征队，还带来了大量病毒、病菌，光带有鼠疫杆菌的跳蚤就有8㎏。