众人慌不择中的在狭小的岩石缝隙之中来回跑动，也多亏了路卡利欧他们和白夜的波导感应才不会使得众人在山谷之中迷路。
小智疑惑的问道：“为什么那知雷吉洛克要攻击我们啊？”
“他说不准我们靠近。”
白夜也说道：“作为梦幻所居住的世界初始之树，不仅能力强防御也很高，自然门口作为保安防御守护大树的都是神兽，看到我们这些人类居然靠近世界初始之树自然会攻击我们。”
在石洞中走了一会之后总算是来到了出口，眼前映入眼帘的是仙境一般的风景和飞流直下三千尺的瀑布。
“早就听说世界初始之树的名声，没想到居然还这么漂亮。”
“小夜你是怎么知道的？”
“当然是它告诉我的。”
“它？”
白夜没有继续回答小智的问题，反而看着周围的环境推断道：“我们现在应该是在世界初始之树的最下方，皮卡丘他们应该和梦幻待在一起也就是树的顶部位置。”
“好！我来找你了皮卡丘！”小智听到后二话不说就朝着旁边的斜坡上跑去，按照他的想法就是一直往上走就可以到顶端了。
看到旁边的琪朵想要利用无人机来研究世界初始之树的资料，白夜稍稍发出一些警告之后就跟了上去。
凭借自己这个博士身份，要是遇到个犯法的关他一辈子的牢也不是不可以。
与此同时，坐在车子后面后备箱的火箭队二人组武藏和小次郎也顺势来到了世界初始之树，不过看着后面的雷吉洛克两人还没看多久立马又朝着白夜他们离去的方向跟了上去，他们可不想被雷吉洛克的破坏死光给炸上天。
小智通过回声的呼喊也是大致确定了皮卡丘的所在位置，一路上和路卡利欧还有白夜他们跑个不停。
这就为难身后小遥小刚等人了，他们的运动和白夜小智他们比起来那是差远了。
就在小智想继续往前进的时候，一个冰锥般的身影出现在他的面前拦住了他们的去路。
“雷吉艾斯，是急冻光线！小智快躲开！”
看着雷吉艾斯要对他们释放急冻光线，白夜立马拉着小智的手往一边躲过这一发攻击。
“路卡利欧，波导弹！”看着雷吉艾斯还要对他们发动攻击白夜一边手搓波导弹一边对着路卡利欧说道。
三发波导弹合成一个巨大的波导弹直接碾压急冻光线打在了雷吉艾斯身上。
趁着雷吉艾斯倒在地上众人赶快切换路线，毕竟不只有一条道路能够通往终点。
在和赶路的小遥他们汇合之后白夜一行人赶忙朝着一个新的石洞口跑了进去。
这个小调皮在干什么呀？明知道我们来了还不快把防御模式给关闭，是存心捉弄我们吗？
山顶上皮卡丘仙子伊布等神奇宝贝看到小智白夜来找他们了也顾不上等待，立马朝着下面跑去，身后则是一脸懵逼跟着跑的喵喵和一脸开心的梦幻。
跑了一会之后，众人面前的景象就像是身体里面一根根血管联在一起的空间。
上方突然传来惨叫声，众人抬头一看发现是武藏和小次郎踉踉跄跄的从悬崖边上一跃而下跳到了小智白夜面前。
“求求你们了，不管是白发小鬼头还是谁快点阻止他们啊！”
小次郎手指的方向正是追赶过来的雷吉洛克和雷吉斯奇鲁。
这下子三圣柱都凑齐并且看到了，也是自己比较喜欢的，看样子又可以多三只传说神奇宝贝。
“大家快来这边！”
“luka！”
两只路卡利欧凭借波导立马指出一条道路对众人喊道。
众人立马慌不择众顺着蓝色的水晶支柱逃进洞口里面，两只路卡利欧和白夜用波导弹造成障碍之后也赶忙跟上大部队脚步。
然而众人都没发现的是，此时整个世界初始之树的水晶由原本的蓝色迅速闪过一抹橙色，又迅速变回了蓝色。
“武藏等等我呀！”小次郎跑的上气不及下气，这比平常他们跑步还要猛烈很多。
“真是的都跟你说了平常要多跑跑步你偏不听，一到危险的时候就会拖后腿……”
“后面！”武藏话还没说完小次郎一脸惊恐地用手指着她的后面。
“什么嘛，又不是小孩子了，这种三岁小孩才会信的把戏就不要再甩了……”武藏话还没说完身体就感觉好像被什么包裹住了一样，随后扭头就看见一个不明的橙色粘糊糊物体正附在她的身上。
小次郎赶忙叫出沙漠奈亚让他用飞弹针试试能不能解救武藏，但结果是……没用！
“实在是好讨厌的感觉呀！”这是武藏在被完全吞噬前的最后一句话。
等到众人赶到的时候见证的就是小次郎又被吞噬的那一刻。
“魔尼尼，你快点逃啊！”在最后一刻小次郎拿出神奇宝贝球释放出了魔尼尼。
身后雷吉洛克等神奇宝贝又追了上来，面对前面的不明物体白夜两手波导弹迅速齐出，身后两只路卡利欧做后卫抵挡雷吉洛克等神奇宝贝的攻击。
小遥一脸害怕的说道：“那到底是什么东西啊？”
白夜道：“如果把世界初始之树和人体相对比的话，那些不明橙色物体就相当于是人体内的白血球，他们把我们当成入侵身体的细菌了。”
“不过有一点就是，他们不会吞噬神奇宝贝，因为神奇宝贝就是世界初始之树的一部分。”
小遥是真的害怕了：“不管什么都好，总之咱们快找到皮卡丘他们赶快离开这里。”
这一次没有出现原剧里面众人兵分两路的情况，因为其他的路全都已经被雷吉洛克他们给堵死了，剩下的一条还是白夜和路卡利欧他们用波导弹轰出来的。
皮卡丘和仙子伊布他们也在石洞之中凭借着嗅觉和感知力在寻找小智白夜他们，已经非常非常的近了。
最终，在类似于藕断丝连的地方的位置，外面根本没有任何的石头防御，两个洞口之间仅有着数条蓝色的水晶钢柱作为联系。
两方相遇了。