飞行船上，小智和超梦都被眼前这个自称迷之收藏家吉尔露太的神秘男人给“抓”了。小智与超梦以及火焰鸟被关在了一个很大的空间中。
吉尔露太看到超梦开心道：“没想到你居然有人造宝可梦超梦啊！还真是意外之喜，虽然让闪电鸟跑了，但我只需要再去抓一次就行了！”
小智问道：“既然都被你抓了，我想知道你抓三圣鸟的目的是不是海之神洛奇亚呢？”
吉尔露太大笑道：“没错！收藏家要做的就是将自己的藏品展示出来，三圣鸟和洛奇亚就是目对我而言最好的收藏品，对了小弟弟还要加上你的超梦。”吉尔露太按下了一个按钮，小智从特制的笼子里放了出来。
吉尔露太道：“你是多余的，就让你在这里尽情欣赏我的收藏品吧！不过可不能用手碰哦！这可是基本的礼节。”
吉尔露太笑着满意的离开了！
小智站了起来，露出了一个狡黠的笑容，太自信就是吉尔露太的致命弱点，他拿出了梦幻的大师球：“梦幻就决定是你了！”
“咪呜！”小智我在精灵球里都听到了。
小智之前的Z手环在大木博士那里，他之后又花了的积分兑换了三个，准备给伙伴们用，没想到现在有了用武之地。他从系统背包中拿出了其中一个Z手环，更换上了梦幻Z。
“上吧！梦幻！瞄准那个黑色圆环，使用起源超新星大爆炸！”
“咪呜！”梦幻的专属Z招式命中了黑色圆环。
超梦在黑色圆环碎裂的时候，使用了精神击破直接脱困。小智假装被抓住，就是要趁机将火焰鸟救出来。
小智焦急道：“火焰鸟你没事吧！”
“我没事，只是被吸走了太多的力量了，现在没有力气。”火焰鸟用心电感应对小智说道。
【火焰鸟】
【属性：火、飞行】
【特性：压迫感（给予对手压迫感，大量减少其使用的招式的pp）】
【实力：神兽级（神职）】
小智跟124号兑换了一个可以恢复火系宝可梦体力的能量方块。火焰鸟吃下后，精神了不少，124号出品必是精品，效果很是明显。
“咪呜。”小智你看外面。
小智抬头看去，透过飞行器的玻璃，外面竟然开始下暴风雪了！
“梦幻用你的瞬间移动我们去冰之岛！”
“咪呜！”好的！
梦幻的瞬间移动包裹住小智、皮卡丘、超梦以及火焰鸟，眼前的景物一闪就到了冰之岛上空。
小智的身体在猛地下坠，火焰鸟将其托在了背上。
小智对梦幻和超梦道：“你们都先回来吧！”随即小智对火焰鸟道：“火焰鸟带我先去找我的同伴吧！”
“坐稳了！”火焰鸟加快了速度。
这时，小智的通信装置响了起来，渡道：“小智，你那边情况怎么样了？”
小智道：“渡先生，我将火焰鸟救出来了！”
渡道：“具体的我们等事情结束再说，我遇到你的同伴们了，我去拿冰之岛的宝藏，雷之岛的宝藏就交给你了！”
小智道：“好，渡先生我们在亚西亚岛见。”
小智挂断了通信装置，对火焰鸟道：“火焰鸟我们转道去雷之岛。”
冰之岛附近被困在结冻海面上的小霞等人，听到渡得到了小智的消息后都松了口气。渡对众人道：“我现在去拿冰之岛的宝藏，火焰鸟已经被小智救了出来。”
小智这边也在雷之岛上拿到了宝藏，火焰鸟突然向身后使用了喷射火焰，失去理智的急冻鸟使用了急冻光线对抗火焰鸟的喷射火焰。
【急冻鸟】
【属性：冰、飞行】
【特性：压迫感（给予对手压迫感，大量减少其使用的招式的pp）】
【实力：神兽级（神职）】
火焰鸟道：“小智你快走！我和闪电鸟的力量都被吸走了大半，我挡不住急冻鸟的，你先回亚西亚岛！”
小智担心道：“火焰鸟，你撑的住吗？”
火焰鸟道：“时间不长，应该问题不大。小智你是那位大人选中的训练家，这件事只有你能去办，你先回亚西亚岛。海底的另外一个大人也快醒了！我只需要拖住一时半刻就行了！”
小智道：“好，我能感觉到闪电鸟也在赶过来的路上了。”小智抱上皮卡丘，坐在了大嘴雀的背上，就先离开了。
火焰鸟说的对，要想让急冻鸟平静下来，必须将宝藏放到它们应该在的地方。在三分钟后，闪电鸟也赶到了，三圣鸟在空中缠斗在了一起，但闪电鸟和火焰鸟的力量明显被急冻鸟给压制着。
突然一道冲天的海流拦在了三圣鸟的中间，是洛奇亚。洛奇亚终于也醒了！
【洛奇亚】
【属性：超能、飞行】
【特性：压迫感（给予对手压迫感，大量减少其使用的招式的pp）】
【实力：神兽级（神职）】
悠扬的笛声在这个时候响起，这是芙卢拉？
小智看见了小刚驾驶着船朝小智的方向驶来，小智跳到了甲板上，小霞关心道：“小智你没事吧！”
小智摇了摇头：“我没事！果然跟传说一样，芙卢拉的笛子有安抚众神的作用。”
芙卢拉的笛子让战斗的场面平缓了不少。
渡的声音传来：“小智，接住！我还要去逮捕那个谜之收藏家。”小智伸手将东西接住，这下三个宝藏集齐了。渡调转了方向，去追逃跑的吉尔露太。
小刚也加大了马力，朝亚西亚岛赶了回去。
二十分钟后，小智一行人赶往神殿。小智将三颗珠子放在了对应的位置后，朝芙卢拉点了点头，芙卢拉悠扬的笛声再次响起，这次天空中的雷云开始消散，暴风雪也停止了，急冻鸟也慢慢地平静了下来。
小健喃喃道：“天地震怒，世界面临毁灭的时候，海之神将会出现，与优秀的控制者一起平息众神的怒气。原来竟然是这个意思！”
一切平息后，洛奇亚带着三圣鸟来到了亚西亚岛的海边。
“小智谢谢你！”洛奇亚降落到了小智身边。
小智笑道：“洛奇亚你不用客气！”
洛奇亚道：“要不是你的话，灾难造成地影响会是巨大的。真不愧是凤王那个家伙选中的人啊！”
“小智谢谢你！”三圣鸟也降落在了洛奇亚身后。
小智道：“你们这么说，我都不好意思了！好了，这些都是我应该做的事！”
【剧情任务洛奇亚的爆诞已完成，剧情任务奖励积分，触发支线任务，收服三圣鸟。完成支线任务后，剩下的奖励才会发放。】
洛奇亚道：“小智，这是我们的谢礼！”洛奇亚发出了一道蓝光没入了小智的身体中。
【恭喜宿主得到海之神洛奇亚的赐福，获得海神使者的称号。等宿主到达圆朱市和漩涡列岛后，凤王使者和海神使者的称号将发挥作用。】
“到我们了！”三圣鸟道。
火焰鸟道：“小智，我们三个就送你三只我们族群中的优秀后辈吧！相信跟着你，它们都会有所成长的。闪电鸟的后辈在黑云市附近的发电站，急冻鸟的后辈在双子岛的深处，而我的后辈则是在灯火山。”
小智道谢道：“我也要谢谢你们！”
三圣鸟回到了属于各自的小岛之上，洛奇亚则回到了海洋深处继续沉睡。
通信装置再次响起，渡的声音传来：“小智，那个自称谜之收藏家的家伙已经被我逮捕了，联盟的消息海流已经恢复到平常的水平的，这件事算是平安解决了！”
小智道：“那就好！”
渡道：“我向联盟申请了对你的奖励，我会派人送到真新镇的。我还要处理接下来的事情，我就先挂了！”
小智道：“好。”
通信装置被挂断。
完成了亚西亚岛的庆典后，第二天小智一行人继续前往橘子联盟的最后一个道馆榴柑岛。