“我们现有的通用超算，如同用渔网去过滤病毒，工具本身就不匹配。生命科学的数据具有高度的非结构化、多模态、动态演化的特性。通用超算的架构，并非为此而生，效率极其低下。”
这时，他才翻开白皮书的核心摘要，开始进行技术层面的精准剖析：
“‘方舟’计划的核心，不是追求绝对峰值速度的纸面数字，而是追求对生命科学特定问题的极致求解效率。我们规划的架构创新主要体现在三个方面：”
他指向架构图：
“第一，异构融合计算架构。 并非简单堆砌cpU和GpU，而是根据生物计算任务的特点，定制化集成图计算单元用于处理蛋白质相互作用网络、动态规划专用处理器用于分子动力学模拟的关键步骤、以及稀疏矩阵加速单元用于处理海量但稀疏的生物数据，实现‘专用芯片干专事’，从根本上提升能效比。”
“第二，原生多模态数据融合处理引擎。 从硬件层面和底层软件层面，打破基因组、蛋白质结构、冷冻电镜图像、质谱数据、活细胞影像等不同维度数据之间的壁垒，设计统一的数据表达和交换格式，让超算能‘天生’理解并协同处理这些复杂的生物信息。”
“第三，内置AI驱动的研究范式。 将机器学习、人工智能不再是作为外围工具，而是作为核心工作流嵌入系统。让超算不仅能‘计算’，更能通过分析已有数据‘学习’生物学规律，主动提出可验证的假设，甚至反向指导我们设计下一步的关键实验，形成‘计算-实验-再学习’的智能闭环。”
他列举了几个极具说服力的应用场景：
“例如，在新发突发传染病应急响应中，‘方舟’能快速模拟病毒蛋白与人体受体的结合过程，大幅缩短抗体和药物筛选时间。”
“在精准医疗领域，能整合患者的基因组、蛋白组和临床数据，构建数字孪生模型，为个体化治疗方案提供动态预测。”
“在国家粮食安全层面，能加速我们研究院‘智能沉默弹头’等技术的优化，设计出抗病高产的智能作物。”
汇报持续了近一个小时，陆时羡逻辑清晰，数据翔实，既展现了宏大的科学愿景，又落到了具体的技术创新和国家需求上。
他没有刻意回避投资的巨大，但更强调了其可能带来的颠覆性回报。
汇报完毕，会议室陷入短暂的沉默。一位来自总装备部的专家沉吟片刻，提了一个关键问题：“陆院士，按此设计，这台超算的算力，将达到何等量级？它对能源、冷却、运维的要求如何？”
陆时羡早有准备：“初步规划，其双精度浮点运算能力需达到10 Exaflops（百亿亿次） 以上，并在特定生物计算任务上，实际效能相比现有通用超算提升百倍至千倍。”
“我们建议采用液冷为主、风冷为辅的混合冷却方案，并利用江南地区的水网优势，选址靠近大型水体，以降低能耗和冷却成本。运维团队将由繁缕和合作的计算所共同组建。”
科技部的负责人最后提问，问题直指核心：“国际上有无类似计划？我们是否具备独立实现的技术基础？”
“据我们所知，尚无如此深度定制、目标明确的生物专用超算计划。米国、欧洲虽有加强生物计算投入的趋势，但大多基于现有通用架构优化软件。”
陆时羡语气坚定，“在E级超算（百亿亿次）设计、异构计算、AI芯片等领域，我国已积累深厚。‘方舟’计划是站在巨人肩膀上的跨越，是将已有技术优势，转化为特定领域绝对领先的战略举措。我们有信心，也有能力实现。”
会议结束后，发改部门的司长与陆时羡握了握手，表情比开始时缓和了许多：“陆院士，您的汇报非常精彩，也极具战略眼光。‘方舟’计划意义重大，但涉及面广，投资巨大，我们需要进行更深入的可行性研究和综合评估。请保持通讯畅通。”
离开发改委大楼的时候，秋日的阳光照在身上，已经带着一丝暖意。
陆时羡也清楚的知道，华国决策需要时间，但他已经成功地将“方舟”的种子，播撒在了最高决策层的土壤里。
该做的都已经做了，接下来就是等待了。
当然，也不能什么都不做。
接下来，他将启动备用方案，一方面寻求与国内顶尖超算中心和企业的深度合作，进行先期技术验证。
另一方面，继续夯实“枢纽蛋白”研究的实验基础，确保一旦“方舟”起航，他们能立刻扬帆，驶向那片等待被揭示的生命微观宇宙。
燕京之行，只是这场更大战役的序幕而已。
陆时羡离开后，那份厚重的《生物专用超算系统技术需求白皮书》如同一块投入平静湖面的巨石，在国家发改委内部及相关部委间激起了层层波澜。
一场关乎国家重大科研基础设施投资的激烈争论，在更高的决策层面悄然展开。
数日后，一次由更高层级领导主持、多个关键部门参与的内部协调会议，在气氛凝重的会议室里进行。
科技部的代表率先发言，语气中带着审慎的支持：“陆时羡院士的‘方舟’计划，其科学前瞻性和战略意义是毋庸置疑的。生命科学正在与信息科学深度交叉，计算能力已成为决定科研上限的关键。”
“如果我们能率先建成这样一台专用超算，无疑将在国际科技竞争中获得显着优势。从长远看，这笔投资是值得的。”
然而，话音刚落，财政部门的代表便皱起了眉头，他推了推眼镜，语气务实而尖锐：
“我完全理解科技创新的重要性。但各位，我们必须面对现实。初步预估，‘方舟’计划的直接投资将高达数十亿甚至近百亿元人民币，这还不包括后续每年数亿的运维和升级费用。目前国家在‘天河’、‘神威’系列后续机型上已有庞大预算，各地也在申报各类数据中心。”
“如此巨额的资金投入一个由单个研究院主导、目标看似非常‘专一’的项目，其投入产出比如何评估？风险如何控制？”
“我们如何向全国人民解释，为什么要花这么多钱，去‘寻找’一个可能根本不存在的蛋白质？”